诊断必须根据病史、临床表现和实验室检查结果进行全面分析，慎重做出确诊。
（一）病史
有不洁性交史或通过其他途径直接或间接接触患者分泌物史，且接触后至发病的时间与淋病潜伏期相一致。
（二）临床表现
有尿痛、尿频、尿急、尿道口流脓或白带多，宫颈口、幼女阴道脓性分泌物，或如前述有其他器官或系统相应症征，再根据不同表现确定其临床类型。
（三）实验室检查
涂片检查中性粒细胞内革兰阴性双球菌或经培养证实。
需与男性淋病相鉴别的疾病有：
（一）非淋菌性尿道炎
虽亦有不洁性交史，但潜伏期长（1～3周），症状轻微，尿道分泌物量少，呈浆液性或粘液脓性。沙眼原体和解脲支原体为主要病原体，少数可由阴道毛滴虫、念珠菌或单纯疱疹病毒引起，大肠杆菌见于男性同性恋的尿道炎患者。淋球菌检查阴性。
（二）非特异性尿道炎
指与性病无关的细菌性尿道炎，如继发于包茎的尿路感染，或继发于尿道导管插入术和其他尿道器械操作引起的损伤后感染。镜检常为革兰阳性球菌。
（三）Reiter综合征
主要症状发生次序为尿道炎、结膜炎和关节炎。发病与HLA-B 相关，病因多为沙眼衣原体（性病型）、肠道福氏痢疾杆菌（肠型）。偶见于淋菌性尿道炎后发病者，尚可伴发脓溢性皮肤角化症（掌跖多见）及环状龟头炎等皮肤粘膜损害。
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